新華社北京9月13日電(記者丁靜 張驍)一張全基因組育種芯片上均勻分布超12萬個基因位點,檢出率和檢測準確率超99%,技術(shù)達國際先進水平……12日在第三十屆中國北京種業(yè)大會上,荷斯坦牛中高密度基因組選擇育種芯片發(fā)布,標志著我國荷斯坦牛中高密度育種芯片自主設(shè)計開發(fā)取得重要突破。
荷斯坦牛是當前世界奶牛的主要品種,作為單胎大型動物,選擇出優(yōu)秀種公牛是奶牛育種的核心工作。
近年來,國際上已進入奶牛基因組選擇育種時代,使用中高密度育種芯片,能使種公牛培育周期由約6年縮短至約2年,育種效率顯著提升。
“十四五”國家重點研發(fā)計劃項目首席科學家、中國農(nóng)業(yè)大學教授孫東曉說,我國近年來加速構(gòu)建和優(yōu)化奶牛基因組選擇育種技術(shù)平臺,但過去完全依賴國外育種芯片,國內(nèi)種牛檢測樣品需要送到國外實驗室檢測,存在技術(shù)“卡點”及生物信息安全風險。
2020年,首農(nóng)食品集團北京奶牛中心、中國農(nóng)業(yè)大學、華智生物技術(shù)有限公司啟動荷斯坦牛育種芯片自主開發(fā)聯(lián)合攻關(guān),基于過去多年的科研成果,挖掘、鑒定了一批針對我國荷斯坦牛群體遺傳背景的基因位點,自主設(shè)計了涵蓋超12萬個位點(即126K)的育種芯片,可通過牛的毛發(fā)或血液等,檢出基因突變位點、遺傳缺陷位點、親子鑒定位點、其他多組學來源數(shù)據(jù)位點等。
近日,專家組論證認為,芯片設(shè)計科學合理,驗證程序完善,參照國際同類產(chǎn)品標準,達到產(chǎn)業(yè)化推廣應用水平,可用于荷斯坦?;蚪M選擇參考群體的構(gòu)建及種牛評價。
“這是我國荷斯坦牛育種領(lǐng)域首款中高密度育種芯片,對提升我國種公牛自主培育能力和水平,進一步完善奶牛種質(zhì)自主評價體系具有重要意義?!敝袊?a>奶業(yè)協(xié)會副秘書長陳紹祜說。
中國奶業(yè)協(xié)會育種專業(yè)委員會主任麻柱說,奶牛育種自主創(chuàng)新聯(lián)盟將率先用上這款芯片,助力保障我國奶牛自主選育體系穩(wěn)定運行,維護生物信息安全。
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