2月17日,中國(guó)科學(xué)院院士黃路生領(lǐng)銜的江西農(nóng)業(yè)大學(xué)科研團(tuán)隊(duì)在國(guó)際頂級(jí)學(xué)術(shù)期刊《Nature Communications》發(fā)表重要科研成果,提供了目前為止國(guó)際上最為全面完整的豬腸道微生物基因集和宏基因組組裝的微生物基因組。該成果為豬腸道菌群相關(guān)研究以及分析腸道菌群對(duì)豬生長(zhǎng)速度、飼料利用率等經(jīng)濟(jì)性狀的影響等提供了重要的基礎(chǔ)數(shù)據(jù)和資源。
據(jù)了解,豬的胃腸道中有數(shù)百萬(wàn)億細(xì)菌,它們?cè)谪i的新陳代謝、免疫甚至行為中起著至關(guān)重要的作用,參考基因及高質(zhì)量的微生物基因組是研究腸道菌群與豬的重要經(jīng)濟(jì)性狀的因果關(guān)系必不可少的資源,但目前已有的數(shù)據(jù)庫(kù)中,40%-50%的腸道微生物缺乏參考基因組和注釋信息。研究中,黃路生院士及江西農(nóng)大首席教授陳從英帶領(lǐng)團(tuán)隊(duì)通過(guò)對(duì)來(lái)自不同年齡、性別、品種、地理區(qū)域、不同腸道部位和來(lái)源野豬的500個(gè)樣本,進(jìn)行深度宏基因組測(cè)序,并整合現(xiàn)有的豬腸道菌群基因組,構(gòu)建了整合的豬腸道微生物基因目錄(PIGC)和基于宏基因組組裝的微生物基因組(MAG)。
據(jù)悉,作為構(gòu)建的豬腸道微生物基因集和MAG使用的范例,該研究還比較了野豬和高度商業(yè)化杜洛克兩種代表截然不同飼養(yǎng)條件下的豬腸道微生物組。
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